Geni sa posebnim funkcijama "plutaju" na slične divlje biljne sojove, što ih čini otpornim na herbicide i teško ih je kontrolirati; ili uzrokujući da štetoci proizvedu antitijela protiv insekticida. Osim toga, neka mala stvorenja mogu izumrijeti nakon što jedu genetički modificirane biljke sa insekticidnim funkcijama. Pristalice su iskazile da je sama poljoprivredna proizvodnja aktivnost koja šteti okolišu, a genetski modificirani usjevi neće nanijeti veću štetu okolišu od tradicionalne poljoprivrede. Biljke imaju sposobnost da se odupiru insektima, a poljoprivrednici mogu smanjiti prskanje insekticida, što je korisno za okoliš i biološku zaštitu.
Takve sporove nije lako izvući za kratko vrijeme. Treba reći da je kontroverza o genetski modificiranim usjevima normalna pojava. Prije svega, same novo razvijene sorte nisu savršene, a njihove srednje-do dugoročne efekte na ljudsko tijelo i okoliš ostaju da se vide. Ljudi izražavaju zabrinutost iz legitimnih razloga. Drugo, uvijek će biti nekih konzervativnih ljudi koji nisu navikli na nove proizvode tehnologije i odbijaju ih prihvatiti. Tu je i utjecaj trgovinskih sukoba interesa. Vlade i interesne grupe nekih zemalja koriste neadekvatnost genetski modifikovane hrane za borbu u trgovinskim ratovima, što stvari čini komplikovanim.